第六季开篇，基岩城举办第一届“石器时代杯”足球赛。弗雷德·弗林斯通和巴尼·拉布尔组成了“吼叫者队”，但他们发现对手“洞穴科技城队”竟然使用了违反石器时代体育精神的“轮子”技术。为了公平，弗雷德决定用最原始的石球和脚力硬拼。与此同时，威尔玛和贝蒂为了筹集孩子上学（学如何点石成金）的学费，偷偷开办了一家地下“时尚兽皮”工作室，用恐龙骨头做衣架，生意火爆却要瞒着丈夫。本季经典单集包括《弗雷德的面试恐惧》《大恐龙搬家记》以及《赌石风云》。最终，弗雷德在一场保龄球比赛中领悟了友谊的真谛，而一场火山爆发危机反而让他们家成了全城英雄。
第六季将现代生活与石器时代的错位幽默推向了极致。足球赛的加入让动作戏更足，而女性角色的副线意外地充满独立意识。虽然画质古早，但笑点设计依然吊打当今许多成年动画。
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